Отдел здоровья создан в 1995 году. В состав отдела входят 3 лаборатории. Научный потенциал отдела составляют 3 доктора наук и 4 кандидата наук.

Основными задачами отдела являются:
1. Оценка влияния радиационного фактора на здоровье населения от природных, техногенных и медицинских источников ионизирующего излучения;
2. Разработка мероприятий по минимизации воздействия ионизирующих излучений на здоровье населения.

Специалисты отдела участвуют в решении научных и прикладных задач Роспотребнадзора по Отраслевой научно-исследовательской программе Роспотребнадзора «Научное обоснование национальной системы обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия, управления рисками здоровью и повышения качества жизни населения России», методическом обеспечении и развитии системы контроля радиационного воздействия, внедрении методологии оценки радиационного риска, а также в выполнении научных тем по Федеральной целевой программе «Обеспечение ядерной и радиационной безопасности на 2016-2020 годы на период до 2030 года».

Оценка уровней и оптимизацией медицинского облучения, разработка нормативно-методических документов при использовании источников ионизационного излучения для диагностических и терапевтических целей; вопросы обеспечения радиационной безопасности пациентов и персонала в рентгеновской диагностике (рентгенография, рентгеноскопия, флюорография, компьютерная томография, интервенционные методы диагностики и лечения сердечно-сосудистых заболеваний); внедрение новых радиофармацевтических диагностических препаратов и современных приборов; оценка риска отдаленных последствий от применения излучения в медицинских целях.

Экспериментальные исследования фармакологических препаратов с целью установления возможности их использования в качестве специальных средств радиационной защиты.

Закономерности формирования доз внешнего и внутреннего облучения населения и персонала в нормальных и аварийных условиях.

Анализ доз облучения населения и персонала в условиях нормальной эксплуатации источников ионизирующих излучений и на территориях потенциальной опасности радиоактивных загрязнений.

Федеральный радиологический центр создан приказом Государственного комитета санитарно-эпидемиологического надзора Российской Федерации от 20 декабря 1995 г. № 132 на базе Санкт-Петербургского НИИ радиационной гигиены.
Целью работы Федерального радиологического центра является повышение эффективности государственного санитарно-эпидемиологического надзора за обеспечением радиационной безопасности населения России, разработка и научное обоснование оптимальных подходов к вопросам обеспечения эффективного радиационного контроля воздействия природных и техногенных радиоактивных источников на население, обеспечение научно-методического руководства практической деятельностью территориальных органов Роспотребнадзора по радиационному контролю внешней среды и облучения населения, обеспечение организационно-методического единства в их работе и сравнимости получаемых результатов.

Радиационная безопасность населения при воздействии природных источников ионизирующего излучения в производственных и непроизводственных условиях, радиационный контроль строительных материалов, жилых, общественных и производственных зданий на всех этапах строительства (реконструкции, капитального ремонта), радиационно-гигиеническая экспертиза условий добычи, переработки и использования минерального сырья и материалов в промышленности, радиационный контроль предприятий нефтегазовой отрасли, включая разработку регламента по обращению с производственными отходами с повышенным содержанием природных радионуклидов, разработка региональных программ и обследование уровней облучения жителей населенных пунктов, районов и территорий природными источниками излучения и др.

Оценка доз внутреннего и внешнего облучения человека от различных радионуклидов техногенного происхождения в условиях локальных и масштабных радиоактивных загрязнений окружающей среды, а также при профессиональном контакте с источниками ионизирующего излучения.

Полевая гамма-спектрометрия, мониторинг постчернобыльских территорий России, индивидуальный дозиметрический контроль, паспортизация организаций и территорий, ЕСКИД.

Радиационный контроль сельскохозяйственных и природных продуктов, контроль питьевой воды, расчет доз и моделирование.

Обеспечение готовности управлений и учреждений Роспотребнадзора к проведению профилактических мероприятий по сохранению здоровья населения в случае радиационных аварий и инцидентов.

Практическое и научное обеспечение организации работы по санитарно-гигиенической оценке параметров радиологического мониторинга с использованием информационных технологий.

Научно-организационный отдел осуществляет организационную и информационную деятельность, способствующую выполнению научно-исследовательских работ Института и реализации их результатов, активно участвует в организации и проведении научно-практических конференций, совещаний, в образовательной и редакционно-издательской деятельности Института.

Учебный отдел отвечает за осуществление образовательной деятельности в Институте (лицензия Серия ААА № 002207 рег. № 2109 от 07 ноября 2011 г.) по программам повышения квалификации руководящих работников и специалистов по специальности «Радиационная гигиена и радиационная безопасность».